现阶段(第一期工程)国家卫生信息网的重点应用系统包括"国家卫生信息网卫生防疫信息系统"、"国家卫生信息网网络管理中心"和"国家卫生信息网卫生部局域网"建设。一期工程计划2002年6月完工。一期工程预计投资2.36亿元。中央财政投资1亿元，各级地方政府需要配套约1.3亿元。中央、省、地市和县各级卫生网基础建设资金比例，硬软件和人员培训等各项建设的预算资金比例分别如图所示。

　　随着医疗制度改革的深入，医疗保险信息系统的开发应用成为该行业信息化建设的一个发展趋势。医疗保险信息系统是涉及医疗单位、保险管理机构、参保单位以及居民的财务清算的管理系统。目前国内已有个别地区建立了网络化的医疗保险信息系统。深圳市1992年开始筹建医疗保险信息系统。目前所建成的系统中有47万职工参保。医疗机构将病人刷卡记帐信息通过网络转送社会保险中心，再由中心汇总并处理政府、企业和个人医疗费用投入与消费，处理医疗机构费用结算。到目前为止，系统共有DDN线路38条，电话拨号线路85条，远程通信网点120多个，网络设备总容量达1000多台。

　　三、电子商务和ERP正成为医药信息化的发展方向

　　目前在建的"中国医药卫生电子商务网"(原名"中国金药电子商务网")是我国第一家大型医药专业电子商务网络系统，该系统经过两年多的建设已初具规模，并在全国10个大中城市建立了地区网站，形成了以中心城市辐射周边地区并覆盖全国的网络系统。该系统将陆续建立100个地区服务网站，与Internet相联，形成覆盖全国，并与世界相连的医药网络系统。"中国金药网"包含"中国医药卫生电子商务网"、"全国医药统计网"等专网，以网络形式提供现代高科技的服务保障平台，开展信息交流、科研教学、统计分析、生产管理、信息检索、电子商务等全方位服务。

　　随着医疗制度改革的深入，医药分离成为改革发展的必然趋势。卫生管理部门提出政府药品采购的设想，电子商务系统是实现这一设想所必须的技术支撑环境。这种电子商务建设的目标是以医疗机构、医药公司、银行、药品生产单位、医药信息服务提供商以及保险公司为网络成员，通过Internet网络应用平台，为用户提供安全、可靠、开放并易于维护的医药贸易电子商务平台。目前上海浦东地区、河南驻马店地区已经开始尝试这种系统应用。但是经贸和医药管理的有关部门对发展医药贸易电子商务的意见不尽一致，我国医药行业的电子商务看来还有很长的路要走。